Bisher sind keine Nebenwirkungen bekannt. Aus Vorsichtsgründen wird jedoch empfohlen, dass bestimmte Risikogruppen, wie Schwangere, Schlaganfallpatienten und Personen mit Epilepsie, von der Nutzung von NeuroBeats absehen. Es wird außerdem geraten, die Nutzung auf maximal 60 Minuten pro Tag zu begrenzen. Mit zunehmender Erfahrung kann die Dauer schrittweise angepasst werden.